Klasyfikator molekularny do prognozowania przyszłej utraty przeszczepu w biopsjach przeszczepu nerki ad 8

W oparciu o średni wynik ryzyka, pacjenci zostali przypisani do jednej z 2 grup ryzyka (wysoka i niska), stosując medianę we wszystkich biopsjach jako odcięcie między obiema grupami. W przypadku wielu biopsji od jednego pacjenta zastosowano tylko pierwszą biopsję. Schemat ilustrujący proces budowania klasyfikatora i etapów walidacji przedstawiono na Uzupełniającej rycinie 1. Pojedyncze klasyfikatory genów zostały ocenione tą samą metodą krzyżowej walidacji. W każdym zestawie treningowym wyznaczono n-punktowy gen (n = 1, n = 100, n = 500 lub 5000), a jego wartość ekspresji w odpowiednim zestawie testowym wykorzystano jako wynik ryzyka. Ponieważ w każdym rozłożeniu zestawu treningowego / zestawu testowego może wystąpić inny n-ty ranking, wszystkie wartości ekspresji najpierw standaryzowano, odejmując średnią wartość ekspresji genu i dzieląc przez standardowe odchylenie genu. Pełny klasyfikator pochodzący z zestawu danych Edmonton został również zastosowany do wartości ekspresji genów niezależnego zestawu walidacji z Minnesoty i przypisano oceny ryzyka. Jednowariackie związki pomiędzy ekspresją genów a przeżyciem przeszczepu oceniano za pomocą analizy regresji Coxa (wartość graniczna P = 0,0001). Regresje wielowymiarowe z wykorzystaniem wyniku ryzyka molekularnego, zmian patologicznych i zmiennych klinicznych zostały zbudowane przy użyciu modelu krokowego postępującego, wykorzystującego wszystkie cechy, które osiągnęły istotność (P <0,05) w analizie jednowymiarowej. Fałszywe szybkości wykrywania zostały oszacowane przy użyciu pakietu R fdrtool (43). O ile nie podano inaczej, wartość P równą 0,05 uznawano za statystycznie istotną. Dodatkowe materiały Zobacz dodatkowe dane Zobacz dodatkowy plik Excel Zobacz dodatkowy plik Excel 2 Podziękowania Specjalne podziękowania dla Zija Jacaj za pomoc w zbieraniu danych klinicznych oraz dla Vido Ramassar i Anny Hutton za wsparcie techniczne. Badania te zostały wsparte przez fundusze i / lub zasoby z Genome Canada, Genome Alberta, University of Alberta, University of Alberta Hospital Foundation, Roche Molecular Systems, Hoffmann. La Roche Canada Ltd., Alberta Ministry of Advanced Education and Technology , Roche Organ Transplant Research Foundation, Fundacja Kidney Foundation w Kanadzie i Astellas Canada. P. Halloran prowadził Kanadyjskie Biuro Badań w Transplantologii Immunologicznej do 2008 r. I obecnie jest przewodniczącym Muttart w zakresie immunologii klinicznej. Przypisy Konflikt interesów: Autorzy zadeklarowali brak konfliktu interesów. Informacje referencyjne: J Clin Invest. 2010; 120 (6): 1862. 1872. doi: 10,1172 / JCI41789. Zobacz powiązane artykuły w Gazing do kryształowej kuli, aby przewidzieć wynik przeszczepu nerki, Opracowanie wieloplatformowej sygnatury biomarkerów do wykrywania tolerancji przeszczepów nerkowych u ludzi oraz Identyfikacja sygnatury komórek B związanych z tolerancją przeszczepów nerkowych u ludzi. [przypisy: 23 114 jabłonna, zapalenie stawów u dziecka, jarhead żołnierz piechoty morskiej cda ] [patrz też: dieta wątrobowa lekkostrawna, królik miniaturka baranek, jarhead żołnierz piechoty morskiej cda ]