Klasyfikator molekularny do prognozowania przyszłej utraty przeszczepu w biopsjach przeszczepu nerki ad 5

Porównując wczesne i późne biopsje z wynikami wysokiego ryzyka, stwierdziliśmy różnice w kategoriach diagnostycznych: wczesne biopsje z wynikami wysokiego ryzyka (ale słabe występowanie niepowodzenia) miały głównie ostrą martwicę cewkową i TCMR, podczas gdy późne biopsje z wynikami wysokiego ryzyka ( oraz częstość występowania niewydolności) były często diagnozowane jako mające ABMR lub zapalenie kłębuszków nerkowych (Tabela 8). Ryc. 7 Wskaźniki ryzyka molekularnego w biopsjach pobranych w ciągu roku po transplantacji. Wynik ryzyka molekularnego ma wysoką wartość predykcyjną u pacjentów zagrożonych utratą przeszczepu. Aby ocenić, czy związane zmiany ekspresji genów są unikalne dla zagrożonej populacji, zastosowaliśmy wyniki klasyfikatora do zestawu biopsji pobranych w ciągu pierwszego roku po transplantacji. Tabela 7 Wrażliwość i specyficzność klasyfikatorów zbudowanych tylko na późnych biopsjach lub wczesnych i późnych biopsjach Tabela 8 Rozkład diagnostyczny biopsji wysokiego ryzyka na podstawie klasyfikatora późnej biopsji Aby wykluczyć wysoką liczbę fałszywie dodatnich prognoz we wczesnej grupie biopsyjnej było spowodowane statystycznym odchyleniem (w oparciu o fakt, że klasyfikator został zbudowany na późnych biopsjach i zastosowano go do klinicznie odmiennej grupy wczesnych biopsji), zbudowaliśmy oddzielny klasyfikator na całym zbiorze danych (wczesne i późne biopsje). W tej analizie wynik ryzyka molekularnego nadal wykazywał wysoką wartość predykcyjną dla utraty przeszczepu, ale różnica pomiędzy wczesną i późną biopsją pod względem dodatniej wartości predykcyjnej pozostała (Tabela 7). Zatem odwracalne / leczone wczesne uszkodzenie i odrzucenie może indukować zmiany ekspresji tego samego genu co procesy chorobowe prowadzące do utraty przeszczepu w późnych biopsjach, bez powodowania niepowodzenia przeszczepu. Omówienie W niniejszym badaniu opracowano klasyfikator oparty na ekspresji genów, aby przewidzieć niepowodzenie alloprzeszczepu nerki po późnej biopsji (> rok po przeszczepie) dla wskazań klinicznych. Wskaźniki ryzyka molekularnego były silnie związane z utratą przeszczepu. Korzystając z wcześniej opisanych zestawów transkryptów odzwierciedlających główne zdarzenia biologiczne w przeszczepach nerek, stwierdziliśmy, że transkrypty stosowane przez klasyfikator do przewidywania niepowodzenia przeszczepu były tymi, które odzwierciedlają uszkodzenie tkanki, odróżnicowanie nabłonka i przebudowę tkanki, ale nie odzwierciedlają stanu zapalnego (efekty IFNG i Infiltracja komórek T lub makrofagów). Zdolność predykcyjna klasyfikatora była wysoka, z czułością 0,83 i swoistością 0,63 przy progu wysokiego / niskiego ryzyka. Wynik ryzyka ekspresji genów korelował ze zwłóknieniem i atrofią, zapaleniem śródmiąższowym i zapaleniem kłębuszków nerkowych, ale niezależnie przewidywał niepowodzenie przeszczepu w analizie wieloczynnikowej. Wynik ryzyka został zatwierdzony w niezależnym zbiorze opóźnionych BFC. Ocena ryzyka jest wskaźnikiem aktywnego urazu, którego znaczenie zależy od stanu chorobowego pacjenta. Prognozy dotyczące ryzyka były dokładne, gdy zastosowano je do późnej populacji biopsji, gdzie następna progresja jest znaczna, ale nie w przypadku zastosowania do wczesnych biopsji, w których choroby leczone mają niskie ryzyko progresji. Wczesne po transplantacji choroby powodujące urazy są samoograniczające się (ostra martwica kanalików) lub odwracalne przez terapię (np. TCMR), ale w późnych biopsjach choroby powodujące uszkodzenia postępują i nie reagują na leczenie (ABMR, nawrót choroby pierwotnej). Tak więc prawdopodobieństwo progresji po biopsji w przypadku wskazań klinicznych jest spowodowane zarówno obecnością urazu czynnego (ocena ryzyka), jak i chorobami indukującymi odpowiedź na czynny uraz i ich zdolnością do spontanicznego ustąpienia lub odpowiedzi na leczenie. Klasyfikator i poszczególne geny przewidują ryzyko nie w kategoriach bezwzględnych, ale w odniesieniu do chorób lub mechanizmów urazów zakłócających nerkę i wywołujących biopsję. Transkrypty przewidujące utratę przeszczepu odzwierciedlają ciągłą odpowiedź na uraz, w tym problemy z nabłonkiem i dedyferencjację, z ponowną ekspresją genów rozwojowych i utratą transkryptów związanych ze zróżnicowanym nabłonkiem, jak również przebudową macierzy. Wiele cząsteczek używanych przez klasyfikator do przewidywania postępu w niewydolności nerek jest już znana z tego, że bierze udział w reakcjach na urazy i odgrywa ważną rolę w rozwoju nerek. Na przykład, N-metylotransferaza nikotynamidu (NNMT) i versican (VCAN), oba związane z migracją komórek w raku (21. 24), mogą reprezentować odróżnicowanie i przejście nabłonkowo-mezenchymalne. ITGB6 jest wyrażany przez nabłonek nerek podczas stresu i kontuzji (25) i aktywuje TGFB1 (26). HAVCR1 (znany również jako KIM1) jest ugruntowaną cechą uszkodzonej nerki (27)
[podobne: kolonoskopia przygotowanie do badania, rozwój psychomotoryczny dziecka, oszczędzanie dla dziecka ]
[podobne: chipsy ziemniaczane z piekarnika, szczoteczka soniczna oral b, przychodnia jabłonna ]